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研究熱點丨腸道微生物代謝組學助力揭示肝性腦病新機制

近年來,腸道微生物研究如同打開了一扇通往人體健康奧秘的新大門,數萬億微生物構成的"人類第二基因組",不僅受到飲食、環境、藥物、重大事件等影響,其失衡與代謝、免疫、癌癥等多種疾病緊密相關,研究腸道微生物及代謝產物與疾病發生發展的因果機制,有助于進行疾病的精準預防和治療,相關學術成果頻頻刊登在學術頂刊。

 

2025年1月,南方醫科大學珠江醫院周宏偉課題組聯合多家單位在Nature medicine(IF=58.7)發表了題為“The gut-brain axis underlying hepatic encephalopathy in liver cirrhosis”的研究論文,該研究使用了賽默飛TSQ三重四極桿液質平臺,通過代謝組學、宏基因組、轉錄組等技術,揭示了肝性腦病的腸-肝-腦軸新機制,發現腸道微生物活潑瘤胃球菌(R. gnavus)可以通過苯丙氨酸脫羧酶和代謝產物驅動肝性腦病,為肝性腦病確定了一個有前景的治療和預測靶點

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背  景

約50%-70%的肝硬化患者會發展為肝性腦病,表現為震顫、記憶障礙、昏迷等癥狀,嚴重影響患者生活質量,甚至導致死亡。傳統的“氨中毒”理論及療法無法解釋肝性腦病發病機制,且血氨水平與疾病的發病及嚴重程度不總是一致。多項研究表明,腸道菌群失衡與肝性腦病密切相關。因此,研究團隊從腸道菌群入手,探索肝性腦病的發病機制,為肝性腦病找到新的診療靶點。

 

 

 

技術創新與優勢

該研究結合多組學技術,通過動物實驗及臨床隊列驗證,揭示了腸道共生菌R. gnavus通過苯丙氨酸脫羧酶(PDC)及其代謝產物(PEA)驅動肝性腦病的新機制。PEA是一種神經毒性物質,能夠穿透血腦屏障,對大腦造成損傷,引發肝性腦病癥狀。

 

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代謝組學結合宏基因組揭示R.gnavus 驅動的肝硬化中PDC豐度增加

為了系統地探究腸道微生物與大腦互作的全貌,研究團隊首先構建了112個GBMs腸道-大腦模塊,每個模塊對應特定的神經活性物質生成與降解過程。采用該預測模塊對來自四個肝硬化隊列進行宏基因組數據深度挖掘,發現肝硬化患者的單胺神經遞質模塊顯著富集,在肝硬化患者中增加約10倍,肝性腦病患者增加更多。TSQ 三重四極桿液質分析表明,多種酶可以將芳香族氨基酸轉化為單胺。進一步研究表明,產單胺神經遞質模塊的主要基因是芳香族氨基酸脫羧酶(AADC)編碼基因,并主要由R. gnavus編碼,其中PDC基因豐度與R. gnavus顯著正相關,是單胺合成過程的關鍵酶

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圖1. R. gnavus驅動的PDC基因在4個肝硬化患者隊列中豐度增加(點擊查看大圖)

 

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代謝組學結合轉錄組學揭示肝硬化患者腦部PEA累積

為了驗證R. gnavus 的神經毒性以及PDC的關鍵作用,研究團隊構建小鼠隊列模型,分別對無菌小鼠灌胃野生型R. gnavus及PDC突變菌株。TSQ 三重四極桿液質譜靶向代謝組學分析發現,野生型R. gnavus使小鼠糞便和血清的單胺水平顯著升高,但是腦組織的PEA含量未見明顯變化。后續實驗證實,在肝硬化狀態小鼠中,定植R. gnavus才會導致腦PEA累積,同時小鼠出現記憶障礙、焦慮等典型肝性腦病早期癥狀。通過靶向抑制PDC功能或中和PEA,可有顯著減少大腦中PEA的積累,有效逆轉肝性腦病癥狀,證實了R. gnavus-PDC-PEA軸在肝性腦病中的核心作用

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圖2. 靶向PDC減輕肝性腦病患者糞便微生物引起的神經毒性(點擊查看大圖)

 

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臨床隊列驗證高水平PEA患者肝性腦病風險增加

研究團隊對60名接受經靜脈肝內門體分流術的患者進行了隨訪。結果顯示,術前高PEA水平術后肝性腦病發生風險顯著增加,是低PEA水平患者的7倍,驗證了PEA水平與肝性腦病因果關系,提出血清PEA可能成為肝性腦病發病潛在的預警標志物。

 

 

 

代謝組學:腸道微生物研究的利器

在這項突破性研究背后,代謝組學技術扮演著重要角色。采用代謝組學技術解析腸道微生物代謝物的組成及動態變化,為揭示菌群-宿主潛在的互作機制及疾病發生的因果關聯提供關鍵技術支持。

本研究中糞便、血清及腦部樣品中代謝物檢測采用的是TSQ三重四極桿液質平臺,實現了單胺類物質包括PEA高通量、高靈敏定量分析。賽默飛在代謝組學領域具有一站式解決方案。靶向代謝組學領域,TSQ三重四極桿質譜以低豐度代謝物高度覆蓋,為代謝物精準定量奠定了堅實基礎; 2024年全新推出的Stellar線性離子阱質譜儀在通量、靈敏度及方法開發易用性上全面提升,成為大小分子定量領域耀眼的恒星。非靶向代謝組學領域,更有金標準Orbitrap超高分辨質譜,為隊列樣本檢測提供了超高分辨率、靈敏度及高質量精度,為代謝組學研究者所面臨的的挑戰—樣本基質復雜、代謝產物鑒定數量不足、辨別假陰性/假陽性結果等問題提供強大的技術支撐。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

后記:

 

 

 

 

 

 

 

據悉,研究團隊繼續以R. gnavus-PDC-PEA為核心,深入解析驅動肝性腦病的詳細分子機制,并采用多組學技術全面篩查腸道菌群產生的其他可能神經毒性物質。未來,團隊將探索基于腸道微生物調節的干預策略,推動研究成果向臨床轉化,為肝性腦病患者帶來新的診療方案。

 

 

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